أنشئت هذه الإدارة كأحد إدارات الشؤون الفنية منذ نشأة الأمانة العامة لمجلس الضمان الصحي التعاوني وتُعني هذه الإدارة باستقبال الشكاوي ودراسة المخالفات إن وجدت وإتخاذ اللازم بشأنها أو إحالتها إلى لجنة / لجان مخالفات أحكام النظام ومن ثم متابعة تطبيق القرارات المتخذه بشأن هذه المخالفات.